中山医院开业于1937年，设有除儿科以外的所有科室，综合实力雄厚。心脏、肝癌、肾脏和肺部疾病诊治是医院的重点和特色，诊治水平始终处于国内领先地位。腹部外科、骨科、介入放射、麻醉科、超声诊断和中西医结合等科室以及十余个临床医疗诊治中心皆颇具特色。

妇产科医院创建于1884年，集妇科、产科、中西医结合科、计划生育科、新生儿科、乳腺科、妇产科研究所、上海市中西医结合月经病诊疗中心、上海市女性生殖内分泌疾病诊疗中心、上海市集爱遗传与不育诊疗中心、上海市妇科临床质控中心、卫生部妇科四类内镜诊疗技术培训基地等于一身。

儿科医院创建于1952年，是全国儿科学重点学科、国家"211工程"建设单位。是最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授权点、临床医学（儿科学组）博士后流动站的单位。2008年2月29日，儿科医院闵行区新院区正式投入使用，为服务病人提供了更好的医疗条件。

肿瘤医院创建于1931年，是国内历史悠久、享有盛誉的肿瘤专科医院。设有头颈外科、乳腺外科、胸外科、腹外科、泌尿外科、妇科、化疗科、放射治疗科、中西医结合科、姑息治疗科、麻醉科、放射诊断科、医学检验科、药剂科、内窥镜科、病理科、超声诊断科、核医学科等临床及医技科室。

华山医院共设39个临床医技科室，其中拥有国家级重点学科10个——神经外科、手外科、神经病学、传染病学、中西医结合临床、泌尿外科、肾病科、心血管科、影像医学和核医学、普外科；国家临床重点专科16个——骨科、重点实验室（手功能重建实验室）、专科护理、重点实验室（抗生素研究所）、检验科、神经外科、手外科、内分泌科、中医科（肺病）、神经内科、皮肤科、泌尿外科、肾病科、外科、消化科、中医科（老年病）；上海市临床医学中心2个——神经外科、手外科。华山医院还引进许多国际先进的医疗仪器设备，如高清PET/CT、射波刀、3.0术中磁共振、伽玛刀、256层CT等一大批高精尖仪器，使华山医院医疗设备达国内领先，接近国际先进水平。